黃牧甫生前曾自輯印譜三部，其中最重要者為《黃穆甫印存續補》，因此譜至今尚未見世，可說是孤本，尤顯珍貴。

有關此譜之記載，最早見於適廬《黃牧甫印存續補》（1962）一文。據其所稱，此譜大部分印作是黃牧甫在廣州時所刻，每刻一石，就在紙上朱拓一頁，送給弟子李尹桑（1882∼1945），而部份則是黃氏晚年在武昌所作。後馬國權《晚清印壇巨擘黃牧甫》（2001）及韓天衡《中國篆刻大辭典》（2003），亦曾對此譜有相似記載。此譜之現藏者更詳述其流源。《黃穆甫印存續補》原為黃牧甫拓予其弟子李尹桑，李氏極珍寶之，晚年雖窮困，他物變賣殆盡，惟獨留存此譜；然最後仍因生活所迫，將此譜歸高貞白（1906∼1992）收藏。一九四七年，高氏擬付梓廣傳，並請鄧爾雅（1884∼1954）撰序，序成於同年。惟因故未刊行，鄧氏所撰之序亦因印刷公司失火而散失。可幸鄧序曾於《南金》雜誌影印發表，附錄譜中印拓數方，得以留存（圖一∼三，鄧序全文內容見附錄）。後高氏生前將譜傳於香港林章松先生，林氏改此譜名為《黃牧甫印存十三集》（圖四），現存於其書齋松蔭軒處。

依作者所知見，此譜無疑是黃牧甫自刻印存稿本。每冊規格未全一致，一頁一印，間附邊款，所收印拓，以有款者之紀年為依據，是黃牧甫卅二歲（1882）到五十五歲（1905）所刻之作。這段時期他前後寓居廣州，及於一九○二年應端方（1861∼1911）之邀到武昌協助金石遺存的編輯工作。其中有王秉恩（1845∼1928）、李尹桑、歐陽務耘（1864∼？）、俞旦（1861∼？）用印集及自用印集，另有專冊為其在武昌所刻，該冊封面有黃牧甫手書「黃穆甫印存，光緒二十八、九年武昌所刻」墨書一則（圖五）。故有關此譜之流源，可與上述說法互相佐證。

是譜錄有印拓近七百枚，其中有一百多枚未見於其他譜錄，包括：〈少東〉（1902）、〈茂德長壽〉（1903）、〈松下齋〉（圖三）、〈水雲閣〉（圖三）、〈六有〉（圖三）、〈雪濤〉（朱文刻，圖三）、〈雪濤所藏〉（圖三）、〈六朝金石有源流〉（1890，圖六）、〈讀聖賢書樂神仙道〉（1898，圖七）、〈隴西〉（1899，圖八）、〈以分為隸〉（1900，圖九）等等，揭示了黃牧甫成熟期印風多樣而豐富的特點。